کلیسای فنایی که با نام کلیسای سرکیس مقدس نیز شناخته می‌شود، در روستای فنایی، از توابع شهرستان خوی قرار دارد.
با قدمتی که به سده‌های ۱۶ تا ۱۸ میلادی بازمی‌گردد، مصالح اصلی به‌کار رفته در ساختمان شامل تخته‌سنگ، سنگ‌های لاشه‌ای، آجر و سنگ‌های تراش خورده آذرین می‌شود.
کلیسا متشکل از بخش‌های مختلفی مانند ورودی، محراب، نمازخانه و دو اتاق در طرفین محراب است.
محراب کلیسا سه قوس جناغی دارد که بالای آن‌ها، تزیینات گچ‌بری و مقرنس‌کاری‌های گچی و دورتا‌دور قاب‌های قوس‌های جناغی نقاشی‌های رنگی و نقوش گل و بوته و اسلیمی ایجاد کرده‌اند.
این اثر در تاریخ ۲۵ اسفند ۱۳۷۹، با شماره ثبت ۳۳۸۰ به‌عنوان یکی از آثار ملی ایران به ثبت رسیده است و از مکان های دیدنی خوی محسوب می‌شود.
